Лаборатория микробиологии и биогеохимии водоемов

Заведующий лабораторией: М. В. Иванов

Исследование микробиологических и биогеохимических процессов циклов углерода и серы,определение их в водной толще и донных осадках,количественная оценка процессов окисления и образования метана в водоемах.

Лаборатория нефтяной микробиологии

Заведующий лабораторией: д.б.н., профессор С. С. Беляев

Исследование микроорганизмов в нефтяных месторождениях, их активности, распространения, биологических и метаболических свойств; разработка биотехнологии повышения нефтеизвлечения.

Лаборатория реликтовых микробных сообществ

Заведующий лабораторией: Академик РАН Г. А. Заварзин

Исследование микробных сообществ экстремальных мест обитаний; изучение актуалистической палеонтологии цианобактерий; исследование участия микроорганизмов в газообмене парниковых газов и летучих соединений в ультрапресных холодных условиях.

Лаборатория гипертермофильных микробных сообществ

Заведующий лабораторией: д.б.н. Е. А. Бонч-Осмоловская

Биоразнообразие термофильных прокариот; восстановление металлов и металлоидов термофильными прокариотами; термостабильные ферменты; молекулярная экология термофильных микробных сообществ.

Лаборатория вирусов микроорганизмов

Заведующий лабораторией: к.б.н. А.В. Летаров

Лаборатория хемолитотрофных микроорганизмов

Заведующий лабораторией: д.б.н. Т.Ф. Кондратьева

Лаборатория микробиологии болотных экосистем

Заведующий лабораторией: д.б.н. С.Н. Дедыш

Лаборатория экспериментальной микологии

Заведующий лабораторией: д.б.н. Е.П. Феофилова

Лаборатория экологии и геохимической деятельности микроорганизмов

Заведующий лабораторией: д.б.н. В.М. Горленко

Лаборатория микробиологии антропогенных местообитаний

Заведующий лабораторией: д.б.н. А.Н. Ножевникова

Исследование особенностей микробного состава и функционирования микробных сообществ, осуществляющих деградацию органических веществ и метановый цикл в континентальных местообитаниях; установление различий между природными и антропогенными экосистемами; выделение и описание новых анаэробных и аэробных бактерий.

Лаборатория выживаемости микроорганизмов

Заведующий лабораторией: член-корр. РАН В. Ф. Гальченко

Исследование ауторегуляции адаптации и устойчивости микроорганизмов к стрессовым воздействиям среды; изучение особенностей морфологии и циклов развития олиготрофов, условий коммуникации бактерий и отклика на физические поля и излучения; изучение биоразнообразия и филогении микроорганизмов методами полифазной и молекулярной таксономии; систематика и физиология актиномицетов; изучение метанокисляющих бактерий; разработка методических приемов хранения, поддержания и учета культур уникальных и экстремофильных микроорганизмов